入侵并占领了菲律宾，马尼拉就成为西班牙殖民者的首府，经过了七八十年的发展之后，尽管城市的规模并不大，但己经是一座纯欧式风格的城堡一，在城里最显眼的两座建筑是西班牙菲律宾总督府，和圣奥古斯丁大教堂，这是西班牙人占领马尼拉后建造的第一所教堂，也是奥古斯丁会的教会总部，奥古斯丁会是天主教会在马尼拉的势力最大的教会，马尼拉大主教实际就奥古斯丁会的大主教。
这时在菲律宾的总督府里，总督查孔现在和大主教弗朗西斯科发生了激烈的争吵。
原来这时进攻南京商馆的败军己经回到了马尼拉城，逃回来的西班牙士兵只有两个人，立刻向查孔报告了情况，有一支生理人的军队乘坐着三艘商船，己在马尼拉登陆，住进了中国商馆里，人数在五百人左右，全部都装了火枪，同时还有炸弹武器。
查孔也不禁大吃了一惊，生理人的军队怎么突然到达马尼拉，因此对两个逃回来的西班牙士兵详细询问。不过对这两个士兵所说的情况，查孔多半不信，认为这两个人是故意夸大了生理人的实力，生理人的军队有五百人，到是可信，但全部装备火枪最对不可能，能够有一二百支火枪，就很不错了。那么一支五百人的军队，配有一百支左右的火枪，打败一支由十几名西班牙人指挥，一百多名土著的军队，这也是很正常的事情。
但现在让查孔有一些拿不定把握的是，这支生理人的军队是什么性质，也就是说，是属于国家军队，还是个人的私兵或者是海盗。这几点还是有很大的区别，虽然对中国的局势不大了解，但查孔到是也知道，中国现在正在发生内战，而前两次击退西班牙军的，其实只是中国的一个候爵领主的个人私兵。而且中国商馆也是他建立的，因此查孔估计，这支生理人的军队应该是这名候爵领主的个人私兵的可能性比较大，当然确切的结果，还是应该派人去侦察一下。
虽然查孔坚信，在几年以前两次进攻中国战斗的失败并不是生理人的战斗力有多强，而是前任总督科奎拉，远征舰队的司令官徳拉佩纳太无能，但査孔毕竟还是一个军人，虽然不懂什么战略上藐视，战术上重视之类的格言，既然敌人己经打到了自己的眼前，首先摸清楚敌人的实力，还是应该的。
但就在这时，马尼拉大主教弗朗西斯科来找査孔，原来逃回来的土著中有不少是天主教的信徒，回到马尼拉城上后，也向大主教报告了这一战的经过。而且有人还亲眼看见，传教士内格雷多被生理人抓去了。
西班牙军和土著的伤亡，弗
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